מדינת לאגוס היא רכזת של האוניברסיטאות המפורסמות בעולם. האוניברסיטאות המוערכים ביותר כוללות אוניברסיטת מדינת לאגוס, אוניברסיטת כלב, וYaba ספר גבוה לטכנולוגיה. האוניברסיטאות מדורגות גבוהות אלה מציעות לימודים מתקדמים לסטודנטים מחו"ל במאות תחומים, ולכן מדינת לאגוס היא אידיאלית להשכלה גבוהה.

כדי להתקבל לאוניברסיטות הניגריות (שתי האוניברסיטאות ציבוריות ופרטיות בכל מדינה של הפדרציה כולל FCT), סטודנט פוטנציאלי יש לשבת ולעבור בהצלחה UME (בחינה בגרות אוניברסיטאות), אשר מנוהל על ידי משקוף (כניסה משותפת ודירקטוריון בגרות). גם מועמדים פוטנציאליים באופן קבוע מסך אוניברסיטאות בודדים כדי לוודא שהם עד נקוב לאוניברסיטה ברמת העבודה בניגריה.